RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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CLN8-211ENST00000636934 GINM1Q9NU53 330 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 COL4A5P29400 1685 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 VAV2P52735 878 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 KIF5AQ12840 1032 aa20.46■□□□□ 0.87
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CLN8-211ENST00000636934 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-211ENST00000636934 SLC5A5Q92911 643 aa20.46■□□□□ 0.87
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CLN8-211ENST00000636934 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.45■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.44■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 RRAGAQ7L523 313 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.44■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 ABL1P00519 1130 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.43■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.42■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.42■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 PNMA2Q9UL42 364 aa20.42■□□□□ 0.86
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CLN8-211ENST00000636934 NR2F2P24468 414 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 PTGER2P43116 358 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 KIF11P52732 1056 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 NEK9Q8TD19 979 aa20.41■□□□□ 0.86
CLN8-211ENST00000636934 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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