RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PDP2Q9P2J9 529 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TADA3O75528 432 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MBD4O95243 580 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MYL7Q01449 175 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TSPY1Q01534 308 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MECOMQ03112 1051 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 IFT88Q13099 833 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RAPH1Q70E73 1250 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 WWP1Q9H0M0 922 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PIK3R2O00459 728 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RXRGP48443 463 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF544Q6NX49 715 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CNBD1Q8NA66 436 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PRR23AA6NEV1 266 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TOMM70O94826 608 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NPR1P16066 1061 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 LIG3P49916 1009 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RNF169Q8NCN4 708 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ACAP3Q96P50 834 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 GCNAQ96QF7 691 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF3Q9H094 633 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 USTQ9Y2C2 406 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ABCC1P33527 1531 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 H7C0C1 242 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF197O14709 1029 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ATP5OP48047 213 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NUP85Q9BW27 656 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 SNRKQ9NRH2 765 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 GYG2O15488 501 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 KRT7P08729 469 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 GUCY2DQ02846 1103 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 COG4Q9H9E3 785 aa6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TNFAIP2Q03169 654 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ADAM9Q13443 819 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 COPS6Q7L5N1 327 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NGLY1Q96IV0 654 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DACH2Q96NX9 599 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 GID8Q9NWU2 228 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 SELENONQ9NZV5 590 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DR1Q01658 176 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 OCRLQ01968 901 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 FOPNLQ96NB1 174 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 KCNK16Q96T55 309 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 PMLP29590 882 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 MAPK4P31152 587 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CHRNA3P32297 505 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 CDC42EP1Q00587 391 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 STX3Q13277 289 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFA5Q16718 116 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TTC23LQ6PF05 361 aa6.82□□□□□ -1.32
SCN2A-209ENST00000636071 TTC8Q8TAM2 541 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms