RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621805.4

RAB18-209, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB18, Length 4,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18-209ENST00000621805 DEPTORQ8TB45 409 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RUBCNQ92622 972 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MAF1Q9H063 256 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 FAM107BQ9H098 131 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CPVLQ9H3G5 476 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TMX2Q9Y320 296 aa5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MAFGO15525 162 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TBC1D12O60347 775 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 DPEP1P16444 411 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SREBF1P36956 1147 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 BPIFB4P59827 614 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CCNA1P78396 465 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 LDHDQ86WU2 507 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 DESI2Q9BSY9 194 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RPA1P27694 616 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MFAP3P55082 362 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SNX16P57768 344 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CBX1P83916 185 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RPS6KA1Q15418 735 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CEP55Q53EZ4 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TNFRSF25Q93038 417 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TRIM11Q96F44 468 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 LAMB2P55268 1798 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 PLA2G6O60733 806 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 GFPT2O94808 682 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 KIF4AO95239 1232 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CYP4A11Q02928 519 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MTMR1Q13613 665 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TFDP1Q14186 410 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 NCAPHQ15003 741 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 HVCN1Q96D96 273 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 FAM167AQ96KS9 214 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 PP2D1A8MPX8 630 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 H2AFZP0C0S5 128 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ZNF18P17022 549 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CAP2P40123 477 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CYP2J2P51589 502 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SURF1Q15526 300 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 FIGNQ5HY92 759 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 C8orf74Q6P047 294 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 H2AFVQ71UI9 128 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.85□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 POTEB3A0JP26 581 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 POTECB2RU33 542 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 E9PMD0 336 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 CYP3A4P08684 503 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 GBP1P32455 592 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 LIG4P49917 911 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 PSMC5P62195 406 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 GRIN1Q05586 938 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 LRRC41Q15345 812 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 E2F4Q16254 413 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 POTEBQ6S5H4 581 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.84□□□□□ -1.47
RAB18-209ENST00000621805 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms