RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 KRT33AO76009 404 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 HSPA4LO95757 839 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 STARD3NLO95772 234 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PSAPP07602 524 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 RLBP1P12271 317 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 HLA-DPA1P20036 260 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 LMNB1P20700 586 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CDC25BP30305 580 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CHKAP35790 457 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 RGS3P49796 1198 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 HNMTP50135 292 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGDIBP52566 201 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 STAT2P52630 851 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CCZ1BP86790 482 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC34A1Q06495 639 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 FCHSD1Q86WN1 690 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 BBS7Q8IWZ6 715 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 KCNB2Q92953 911 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 GCC1Q96CN9 775 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 OSBPL6Q9BZF3 934 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 GJA3Q9Y6H8 435 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CCDC151A5D8V7 595 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 BTBD18B2RXH4 712 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 KRT36O76013 467 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 IMPDH2P12268 514 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ITGA6P23229 1130 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 BFSP1Q12934 665 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 TCERG1LQ5VWI1 586 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ANKRD40Q6AI12 368 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CTR9Q6PD62 1173 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ANO5Q75V66 913 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 OTUD6AQ7L8S5 288 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 OOSP2Q86WS3 158 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 WASF1Q92558 559 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 HAUS1Q96CS2 278 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 LRRC39Q96DD0 335 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 EPYCQ99645 322 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF556Q9HAH1 456 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHL1Q9NR64 748 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CSADQ9Y600 493 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 A8MXQ7 604 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PFDN1O60925 122 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 DAB1O75553 588 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 GFPT2O94808 682 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 GOLGA8HP0CJ92 632 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 NFKB1P19838 968 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 MSR1P21757 451 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PDE6BP35913 854 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CENPAP49450 140 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PLTPP55058 493 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 STX3Q13277 289 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 IZUMO3Q5VZ72 239 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CASC4Q6P4E1 433 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 DCDC5Q6ZRR9 648 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 TRIM48Q8IWZ4 208 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 AVL9Q8NBF6 648 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 MNTQ99583 582 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 EPN3Q9H201 632 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 EPS8L2Q9H6S3 715 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 KCND1Q9NSA2 647 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ING3Q9NXR8 418 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 SEPT3Q9UH03 358 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 GGT7Q9UJ14 662 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 AP3D1O14617 1153 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 MAN1A2O60476 641 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 WFS1O76024 890 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 HMOX1P09601 288 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 ALOX5P09917 674 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 RHOXF2BP0C7M4 288 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 VARSP26640 1264 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 PPP2R1BP30154 601 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRQ-209ENST00000616559 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms