RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 AIFM3Q96NN9 605 aa30.62■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa30.62■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ADAMTS3O15072 1205 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ERAP1Q9NZ08 941 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.61■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 IQCF3P0C7M6 154 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 PRR16Q569H4 304 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 DAGLBQ8NCG7 672 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.495e-7■■□□□ 12.4
BRD4-208ENST00000597315 RNPEPQ9H4A4 650 aa30.6■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ACTN1P12814 892 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 SELPP16109 830 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 USP11P51784 963 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ACTR2P61160 394 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 TBCKQ8TEA7 893 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 TBC1D22BQ9NU19 505 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.59■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 LARGE1O95461 756 aa30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 MARK3P27448 753 aa30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 OTOP2Q7RTS6 562 aa30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 SETD4Q9NVD3 440 aa30.58■■■□□ 2.49
BRD4-208ENST00000597315 EMSYQ7Z589 1322 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 NRCAMQ92823 1304 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 ZBBXA8MT70 800 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 CIITAP33076 1130 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.487e-7■■■□□ 18.7
BRD4-208ENST00000597315 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 HERVK_113Q902F9 699 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.57■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.56■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 CTDNEP1O95476 244 aa30.56■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 CKBP12277 381 aa30.56■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.56■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 BACH1O14867 736 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 RBL2Q08999 1139 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 PPFIA1Q13136 1202 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 TRIM29Q14134 588 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 FAM160B1Q5W0V3 765 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 SERINC5Q86VE9 423 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 DEFB123Q8N688 67 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 UIMC1Q96RL1 719 aa30.55■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 TREHO43280 583 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 DTNBO60941 627 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 LGR5O75473 907 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 THPOP40225 353 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 RBM25P49756 843 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 STAT5BP51692 787 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 ZNF697Q5TEC3 545 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 TRPC6Q9Y210 931 aa30.54■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 HIC1Q14526 733 aa30.53■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa30.53■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.53■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 HOXC8P31273 242 aa30.52■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 KRT76Q01546 638 aa30.52■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 ZNF618Q5T7W0 954 aa30.52■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.52■■■□□ 2.48
BRD4-208ENST00000597315 M0R2N6 131 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 SLC26A2P50443 739 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 RABEP1Q15276 862 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 GRIK4Q16099 956 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 RASIP1Q5U651 963 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 SAMM50Q9Y512 469 aa30.51■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 DHX15O43143 795 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 ST18O60284 1047 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 ATG7O95352 703 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 RSPH10BP0C881 870 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 KRT2P35908 639 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 IGBP1P78318 339 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 NPY5RQ15761 445 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 INF2Q27J81 1249 aa30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
BRD4-208ENST00000597315 CCDC83Q8IWF9 413 aa30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms