RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 GALNT17Q6IS24 598 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BRAPQ7Z569 592 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SVOPQ8N4V2 548 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BICD2Q8TD16 824 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CLIC6Q96NY7 704 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH8Q9H579 483 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PXMP2Q9NR77 195 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MCM3APO60318 1980 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WWV3 80 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR25O00155 361 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MSTNO14793 375 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NR3C2P08235 984 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB5P18084 799 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC25AP30304 524 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMC4P43686 418 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT85P78386 507 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GHRHRQ02643 423 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKCZQ05513 592 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SEMA3FQ13275 785 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 AP3B2Q13367 1082 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 USP49Q70CQ1 688 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LENG9Q96B70 501 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA32Q96LK8 384 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO40Q9UH90 709 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.83□□□□□ -1.32
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CAPNS1-208ENST00000589162 MSH4O15457 936 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP9AO75110 1047 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ARIH2O95376 493 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CD46P15529 392 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK4P31152 587 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2C19P33261 490 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TXKP42681 527 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ME1P48163 572 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 FCGRTP55899 365 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SP4Q02446 784 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SP3Q02447 781 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE4DQ08499 809 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF1Q13077 416 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP2K5Q13163 448 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GRB14Q14449 540 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A14Q15043 492 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 NFKBIBQ15653 356 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMCX2Q7L311 632 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DPP9Q86TI2 863 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 RETREG3Q86VR2 466 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS22Q8NE09 1264 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 HAS1Q92839 578 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 COPS5Q92905 334 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAML3Q96JK9 1138 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PLIN2Q99541 437 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CSRNP2Q9H175 543 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GJD2Q9UKL4 321 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PFASO15067 1338 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.82□□□□□ -1.32
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