RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA1Q92805 767 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CEP89Q96ST8 783 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SUN2Q9UH99 717 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DYTNA2CJ06 578 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MEIS3P2A8K0S8 358 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 H0Y8X5 98 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LAMTOR5O43504 91 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 GREM1O60565 184 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TPM3P06753 285 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 VIL1P09327 827 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC175P0C221 793 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SETSIPP0DME0 302 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ATP2B1P20020 1258 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ABCD1P33897 745 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DCTN1Q14203 1278 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 E2F5Q15329 346 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH1L2Q3SY69 923 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 TMC4Q7Z404 712 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL6Q8N841 843 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 C8orf48Q96LL4 319 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CD248Q9HCU0 757 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 IFT57Q9NWB7 429 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 MNS1Q8NEH6 495 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF652Q9Y2D9 606 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 FHOD1Q9Y613 1164 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL33A6NCF5 533 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD33BA6NCL7 494 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC6O75061 913 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 VAMP4O75379 141 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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