RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SAR1BQ9Y6B6 198 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 LONRF2Q1L5Z9 754 aa25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 TMX2Q9Y320 296 aa25.62■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ZNF76P36508 570 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 FAM151AQ8WW52 585 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 REEP2Q9BRK0 252 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 FUT8Q9BYC5 575 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 DEF6Q9H4E7 631 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CNTNAP1P78357 1384 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ANO9A1A5B4 782 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 GOPCQ9HD26 462 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CEP72Q9P209 647 aa25.61■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.61■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 RAD17O75943 681 aa25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 NOL4O94818 638 aa25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CASP5P51878 434 aa25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 GMLQ99445 158 aa25.6■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 STK32BQ9NY57 414 aa25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.59■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 TRAF1Q13077 416 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ADAM9Q13443 819 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 DLGAP5Q15398 846 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 TERF2Q15554 542 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 SFR1Q86XK3 245 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 SH2D4AQ9H788 454 aa25.59■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 AKR1B10O60218 316 aa25.59■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 CYP4A11Q02928 519 aa25.59■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 COL4A5P29400 1685 aa25.58■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.58■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 CETN3O15182 167 aa25.58■■□□□ 1.68
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EHD4-202ENST00000569223 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.57■■□□□ 1.68
EHD4-202ENST00000569223 ERLIN1O75477 346 aa25.57■■□□□ 1.68
EHD4-202ENST00000569223 CFBP00751 764 aa25.57■■□□□ 1.68
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EHD4-202ENST00000569223 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.57■■□□□ 1.68
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EHD4-202ENST00000569223 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.56■■□□□ 1.68
EHD4-202ENST00000569223 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.55■■□□□ 1.68
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