RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 JADE2Q9NQC1 790 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF15O94989 841 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 CDC27P30260 824 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 APOBRQ0VD83 1088 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 SMCO2A6NFE2 343 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 STXBP3O00186 592 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA4P34932 840 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.97■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 MAFGO15525 162 aa23.96■■□□□ 1.43
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PPP4C-211ENST00000567642 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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PPP4C-211ENST00000567642 KCNB2Q92953 911 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 BRF1Q92994 677 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 ANO3Q9BYT9 981 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 BARHL2Q9NY43 387 aa23.96■■□□□ 1.43
PPP4C-211ENST00000567642 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.96■■□□□ 1.43
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PPP4C-211ENST00000567642 LCHNA4D1U4 455 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 EPOPA6NHQ4 379 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 RCAN1P53805 252 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM260Q9NX78 707 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 THEGQ9P2T0 379 aa23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 CAND2O75155 1236 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 REC8O95072 547 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 GJB5O95377 273 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 PPFIA1Q13136 1202 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT8Q92599 483 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 RAD9AQ99638 391 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SIP14410 1827 aa23.94■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 AMHP03971 560 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF76P36508 570 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM17P78536 824 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SPRED2Q7Z698 418 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SDF4Q9BRK5 362 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.93■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 ARP10275 920 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SCG2P13521 617 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 RPS6KB1P23443 525 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 AP3B2Q13367 1082 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 GRIK4Q16099 956 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.92■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 NEFLP07196 543 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 PSMA5P28066 241 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 IGBP1P78318 339 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 CEP55Q53EZ4 464 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 AZI2Q9H6S1 392 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.91■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 NFASCO94856 1347 aa23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 GRB10Q13322 594 aa23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 KRT40Q6A162 431 aa23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PPP4C-211ENST00000567642 SREBF1P36956 1147 aa23.89■■□□□ 1.41
PPP4C-211ENST00000567642 ACTR2P61160 394 aa23.89■■□□□ 1.41
PPP4C-211ENST00000567642 FAM26DQ5JW98 314 aa23.89■■□□□ 1.41
PPP4C-211ENST00000567642 RSPH3Q86UC2 560 aa23.89■■□□□ 1.41
PPP4C-211ENST00000567642 PHKBQ93100 1093 aa23.89■■□□□ 1.41
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