RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KRIT1	O00522	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KRT37	O76014	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PDE6A	P16499	860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	LIMS1	P48059	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	STRN3	Q13033	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		A0A1B0GTL3	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	WNT9A	O14904	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SLC27A2	O14975	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CYBB	P04839	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MPO	P05164	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	JAM2	P57087	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PLP2	Q04941	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GPR19	Q15760	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	HRK	O00198	91 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CBX4	O00257	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FFAR3	O14843	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SGSM2	O43147	1006 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GAS7	O60861	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NPTXR	O95502	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	LTF	P02788	710 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	AMY2A	P04746	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	INSRR	P14616	1297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	AMY2B	P19961	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SLC6A11	P48066	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	AMPD3	Q01432	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	USP7	Q93009	1102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DSE	Q9UL01	958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TRAF5	O00463	557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MAFK	O60675	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ADRB1	P08588	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SCNN1B	P51168	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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