RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 LGALS2P05162 132 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF286BP0CG31 522 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RFC2P35250 354 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SREBF1P36956 1147 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADCY7P51828 1080 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCL23P55773 120 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANAPC15P60006 121 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 AP3B2Q13367 1082 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF365Q70YC5 407 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CAGE1Q8TC20 777 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MARVELD3Q96A59 401 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPR20Q99678 358 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 JADE2Q9NQC1 790 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 H3BRB1 525 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 DPYSL4O14531 572 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP9AO75110 1047 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PFKMP08237 780 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP3A4P08684 503 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDT7P0C024 238 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 IQCF3P0C7M6 154 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACRP10323 421 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAM17P78536 824 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 BFSP2Q13515 415 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HIC1Q14526 733 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPNMBQ14956 572 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTGISQ16647 500 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MCTP2Q6DN12 878 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 DEFB123Q8N688 67 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCLYQ96I15 445 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANO3Q9BYT9 981 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MEIS1O00470 390 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SORBS3O60504 671 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FGBP02675 491 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNA11P29992 359 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTK7Q13308 1070 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTMR1Q13613 665 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CEP55Q53EZ4 464 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q7L0L9 218 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERINC5Q86VE9 423 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 C7orf31Q8N865 590 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PHKBQ93100 1093 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ALG1Q9BT22 464 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NFASCO94856 1347 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.46□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 COL6A3P12111 3177 aa8.46□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAMTS3O15072 1205 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 EDIL3O43854 480 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 LGR5O75473 907 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 CXCL10P02778 98 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 CKBP12277 381 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 SELPP16109 830 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 CIITAP33076 1130 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARHGAP4P98171 946 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
UBE2CP4-201ENST00000561405 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms