RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 KAT2BQ92831 832 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 PGBD1Q96JS3 809 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 COG5Q9UP83 839 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 SCN5AQ14524 2016 aa22.89■■□□□ 1.26
RABGGTA-210ENST00000559586 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TLL1O43897 1013 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 DEXIO95424 95 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TAP1Q03518 808 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ANO3Q9BYT9 981 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.89■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 ITGB5P18084 799 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PSEN2P49810 448 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 AP3B2Q13367 1082 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 NPY5RQ15761 445 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 BACH2Q9BYV9 841 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 STK36Q9NRP7 1315 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PPFIA4O75335 1185 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CXCL10P02778 98 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SREBF1P36956 1147 aa22.87■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 CERS4Q9HA82 394 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 C6orf50Q9HD87 102 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CDKL5O76039 1030 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 F2P00734 622 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CKBP12277 381 aa22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 ALG1Q9BT22 464 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 HAS3O00219 553 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 RFXAPO00287 272 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 FIBPO43427 364 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 EDIL3O43854 480 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GGPS1O95749 300 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GNA11P29992 359 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 IKBKEQ14164 716 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 ATP9AO75110 1047 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 COL9A1P20849 921 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 RABEP1Q15276 862 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GPRASP2Q96D09 838 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD9AQ99638 391 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 JADE2Q9NQC1 790 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 EMSYQ7Z589 1322 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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RABGGTA-210ENST00000559586 KCNA2P16389 499 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP4P98171 946 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 GPNMBQ14956 572 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 TET1Q8NFU7 2136 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA33Q96N06 139 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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