RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 MYH11P35749 1972 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC26A4O43511 780 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TPM2P07951 284 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CD44P16070 742 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ICAM3P32942 547 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CCNA1P78396 465 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 EPHA7Q15375 998 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF792Q3KQV3 632 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 HAUS3Q68CZ6 603 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GPR142Q7Z601 462 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 MORC4Q8TE76 937 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GSDMAQ96QA5 445 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ARID2Q68CP9 1835 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 STAM2O75886 525 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ADORA2AP29274 412 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TM4SF4P48230 202 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 C17orf99Q6UX52 265 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NLRX1Q86UT6 975 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC12A3P55017 1021 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 UGCGQ16739 394 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SV2BQ7L1I2 683 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 BANK1Q8NDB2 785 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ERMNQ8TAM6 284 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 MAFGO15525 162 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SORBS3O60504 671 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SMC2O95347 1197 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ARIH2O95376 493 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PLA2G4BP0C869 781 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GRM1Q13255 1194 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GRB14Q14449 540 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NCAPHQ15003 741 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ARSHQ5FYA8 562 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TLR2O60603 784 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 INHBEP58166 350 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PDE4DQ08499 809 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CRHR2Q13324 411 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 DYMQ7RTS9 669 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 TPH2Q8IWU9 490 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GDAQ9Y2T3 454 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NFASCO94856 1347 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 AOC2O75106 756 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 MYL1P05976 194 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CYP11B2P19099 503 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CTGFP29279 349 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 DDX12PQ92771 950 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 HPS3Q969F9 1004 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 LXNQ9BS40 222 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 HSPA6P17066 643 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PTGS1P23219 599 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 GNPTABQ3T906 1256 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 STRNO43815 780 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 RHOBTB3O94955 611 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 ASIC1P78348 528 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 EHHADHQ08426 723 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNB1Q14721 858 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 KATNBL1Q9H079 304 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 STK24Q9Y6E0 443 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-209ENST00000559551 RASSF10A6NK89 507 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 EYA4O95677 639 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 CAVIN2O95810 425 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 HTRA3P83110 453 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 KRT76Q01546 638 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 SREBF2Q12772 1141 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-209ENST00000559551 UVSSAQ2YD98 709 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms