RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUDT19A8MXV4 375 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF853P0CG23 659 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT24Q2M2I5 525 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPTNQ6XPR3 784 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPYL6Q8N831 410 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL17REQ8NFR9 667 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRBNQ96SW2 442 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPON2Q9BUD6 331 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 JCADQ9P266 1359 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SASH1O94885 1247 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYN1P17600 705 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEFQ10587 303 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 VMACQ2NL98 169 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXorf38Q8TB03 319 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNNQ9UQP3 1299 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 C5P01031 1676 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHL1O00533 1208 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSL3P1P0C860 447 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL2RBP14784 551 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHKG2P15735 406 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSPA1LP34931 641 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 MVKQ03426 396 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 C8orf37Q96NL8 207 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRP6O75581 1613 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 H0Y8X5 98 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 VAMP4O75379 141 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSTM1P09488 218 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPKAPK2P49137 400 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCKAP1LP55160 1127 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITGB4P16144 1822 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP27B1O15528 508 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNQ3O43525 872 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 IMPDH2P12268 514 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF445P59923 1031 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 NR1I3Q14994 352 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCAF15Q66K64 600 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SP8Q8IXZ3 490 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYT8Q8NBV8 401 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PWWP2AQ96N64 755 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 GP6Q9HCN6 339 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRC1P22897 1456 aa6.92□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLIT2O94813 1529 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAPPAQ13219 1627 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms