RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557679.5

ZNF410-223, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5

Gene ZNF410, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ZNF410-223	ENST00000557679	MCM3AP	O60318	1980 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CTAGE5	O15320	804 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	GGPS1	O95749	300 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MMP3	P08254	477 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ICAM3	P32942	547 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CDK7	P50613	346 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NLRP5	P59047	1200 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ARHGAP1	Q07960	439 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	STK3	Q13188	491 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MTMR1	Q13613	665 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	HIC1	Q14526	733 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	UBE2S	Q16763	222 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	GALNT17	Q6IS24	598 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	METTL7B	Q6UX53	244 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TMEM199	Q8N511	208 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	COPS5	Q92905	334 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PHKB	Q93100	1093 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ANO3	Q9BYT9	981 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CENPF	P49454	3210 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	KIAA0355	O15063	1070 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PFKFB2	O60825	505 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ARIH2	O95376	493 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TIMP1	P01033	207 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	AK2	P54819	239 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	FPGS	Q05932	587 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TDH	Q8IZJ6	230 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	IL31RA	Q8NI17	732 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	GDF15	Q99988	308 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SDF4	Q9BRK5	362 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	JADE2	Q9NQC1	790 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	LCT	P09848	1927 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	GNAT1	P11488	350 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SREBF1	P36956	1147 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PSMC6	P62333	389 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	BFSP2	Q13515	415 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM29	Q14134	588 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NTRK3	Q16288	839 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	PKN1	Q16512	942 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CEP55	Q53EZ4	464 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MFSD5	Q6N075	450 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679		Q6ZNB5	142 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	SESTD1	Q86VW0	696 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	NLRP7	Q8WX94	980 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	BAD	Q92934	168 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	HIPK3	Q9H422	1215 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	AZI2	Q9H6S1	392 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF410-223	ENST00000557679	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		7.5	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms