RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553190.5

MYBPC1-223, Transcript of myosin binding protein C, slow type, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MYBPC1, Length 3,777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYBPC1-223	ENST00000553190	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	N4BP3	O15049	544 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	FCER1A	P12319	257 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ITGB5	P18084	799 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ADSSL1	Q8N142	457 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	P2RX5	Q93086	422 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MMP19	Q99542	508 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MTR	Q99707	1265 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	RGL1	Q9NZL6	768 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	BACH1	O14867	736 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ERCC3	P19447	782 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	BMP6	P22004	513 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	WNK4	Q96J92	1243 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PSAP	P07602	524 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	HUNK	P57058	714 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	NCAPH	Q15003	741 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CHADL	Q6NUI6	762 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCND2	Q9NZV8	630 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PSMC5	P62195	406 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	COASY	Q13057	564 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MYCT1	Q8N699	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	IL31RA	Q8NI17	732 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	LXN	Q9BS40	222 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	THAP9	Q9H5L6	903 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PDHX	O00330	501 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	EML1	O00423	815 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KLRC4	O43908	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CYP11B2	P19099	503 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCNK18	Q7Z418	384 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	BTBD7	Q9P203	1132 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCNJ18	B7U540	433 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ATP1A3	P13637	1013 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SP4	Q02446	784 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	LRRC63	Q05C16	580 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCNJ12	Q14500	433 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	NEDD9	Q14511	834 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ASB14	A6NK59	587 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	SLITRK3	O94933	977 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	POTEJ	P0CG39	1038 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	PTGS1	P23219	599 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	STK4	Q13043	487 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MYBPC1-223	ENST00000553190	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms