RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 RSPH10BP0C881 870 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 CHMP4BP1P59074 171 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 UBE3AQ05086 875 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 PI16Q6UXB8 463 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 ZNF843Q8N446 348 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 CASP10Q92851 521 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 MYL10Q9BUA6 226 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 FOXQ1Q9C009 403 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 VTA1Q9NP79 307 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 RAI14Q9P0K7 980 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 TMX2Q9Y320 296 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 MYH1P12882 1939 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 KALRNO60229 2985 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SHMT1P34896 483 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SLC4A3P48751 1232 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 STARD6P59095 220 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 AAMPQ13685 434 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 TNNI3KQ59H18 835 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 TSSK4Q6SA08 328 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CHST13Q8NET6 341 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 GPR20Q99678 358 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 RAD50Q92878 1312 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 PATJQ8NI35 1801 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 IGSF3O75054 1194 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 PPFIA3O75145 1194 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 RAB11FIP3O75154 756 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 DGKIO75912 1065 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 WEE2P0C1S8 567 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SRFP11831 508 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 MAGEA9P43362 315 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 NRLP54845 237 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ERVFC1P60507 584 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 APBB2Q92870 758 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 WNT8BQ93098 351 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SH2D4AQ9H788 454 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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CS-225ENST00000551253 FSCN2O14926 492 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 TREHO43280 583 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 TTC6Q86TZ1 520 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CPXCR1Q8N123 301 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 GPR152Q8TDT2 470 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 AFG1LQ8WV93 481 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SHDQ96IW2 340 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CAPN8A6NHC0 703 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ZNF806P0C7X5 589 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CEACAM1P13688 526 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 THPOP40225 353 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-225ENST00000551253 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 MORC4Q8TE76 937 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-225ENST00000551253 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-225ENST00000551253 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.43□□□□□ -1.06
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