RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RPA1P27694 616 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SLC26A2P50443 739 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TNFAIP2Q03169 654 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM160B1Q5W0V3 765 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ATP6V0A1Q93050 837 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TIGD1Q96MW7 591 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KATNBL1Q9H079 304 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SPC25Q9HBM1 224 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DISC1Q9NRI5 854 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 STK17AQ9UEE5 414 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 GABRQQ9UN88 632 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SAMM50Q9Y512 469 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TRIM17Q9Y577 477 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CTAGE5O15320 804 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SEPT4O43236 478 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 KINO60870 393 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ATP9AO75110 1047 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PPFIA4O75335 1185 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ATG7O95352 703 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 GGPS1O95749 300 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 MYL1P05976 194 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CYBAP13498 195 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 GRK4P32298 578 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SYKP43405 635 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 AMPD3Q01432 767 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SEMA3FQ13275 785 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 NFKBIBQ15653 356 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 HYIQ5T013 277 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 NCAPH2Q6IBW4 605 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SHC4Q6S5L8 630 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 EEPD1Q7L9B9 569 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CABP7Q86V35 215 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 EXOC8Q8IYI6 725 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 FSIP1Q8NA03 581 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PPTC7Q8NI37 304 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 TRIB2Q92519 343 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CLIC6Q96NY7 704 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 AZI2Q9H6S1 392 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 HPSEQ9Y251 543 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PPME1Q9Y570 386 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ZEB2O60315 1214 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 LYPLA2O95372 231 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 RARBP10826 455 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PFKFB1P16118 471 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CYP2C19P33261 490 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CPT1AP50416 773 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ACTR2P61160 394 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PSMC5P62195 406 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 IL17AQ16552 155 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CCL14Q16627 93 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 LY6KQ17RY6 165 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CYFIP1Q7L576 1253 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 FAM167AQ96KS9 214 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 NACC1Q96RE7 527 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 KCND2Q9NZV8 630 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DNM3Q9UQ16 869 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 EMSYQ7Z589 1322 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ZNF202O95125 648 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SLFN14P0C7P3 912 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SMPD1P17405 629 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms