RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	MTFR1	Q15390	333 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442		Q7L0L9	218 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	COA7	Q96BR5	231 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX33	O43247	280 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GJB1	P08034	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RPA1	P27694	616 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GNG11	P61952	73 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	NFIA	Q12857	509 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT86	O43790	486 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MCM3	P25205	808 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA13	P27216	316 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	STAT2	P52630	851 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS16	Q9H269	839 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFB10	O96000	172 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	GAP43	P17677	238 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC25A	P30304	524 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	UBXN2A	P68543	259 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	STK4	Q13043	487 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	CCL15	Q16663	113 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX12P	Q92771	950 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	STAM	Q92783	540 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	HAS1	Q92839	578 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	MYMK	A6NI61	221 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-223	ENST00000550442	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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