RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRB-208ENST00000550358 LRMPQ12912 555 aa9.19□□□□□ -0.94
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF131P52739 623 aa9.19□□□□□ -0.94
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PTPRB-208ENST00000550358 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 BEST2Q8NFU1 509 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 LPAR1Q92633 364 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 TBX3O15119 743 aa9.19□□□□□ -0.94
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