RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 REEP2Q9BRK0 252 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 LXNQ9BS40 222 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 BTBD7Q9P203 1132 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TMEM150BA6NC51 233 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PPATQ06203 517 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TTI2Q6NXR4 508 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SBF1O95248 1867 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCNE1P24864 410 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 GSDMDP57764 484 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 UBXN1Q04323 297 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 FSTL1Q12841 308 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PPP2R5CQ13362 524 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NR1I3Q14994 352 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RRAGCQ9HB90 399 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 JADE2Q9NQC1 790 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GTH6 734 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 BICDL2A1A5D9 508 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CASP5P51878 434 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 GIT2Q14161 759 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CEP135Q66GS9 1140 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SFR1Q86XK3 245 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RPTORQ8N122 1335 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CYP2C8P10632 490 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 HERVK_113P62684 666 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 LBX2Q6XYB7 198 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RIT2Q99578 217 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 B4DLN1 442 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PGK2P07205 417 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCND2P30279 289 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 OAZ1P54368 228 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCZ1BP86790 482 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NLRX1Q86UT6 975 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MYCT1Q8N699 235 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 USP27XA6NNY8 438 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 GCNT3O95395 438 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 EYA4O95677 639 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SPAG1Q07617 926 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 RBL2Q08999 1139 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 KCNA1Q09470 495 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 EPHA7Q15375 998 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 Q3C1V9 767 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 KSR1Q8IVT5 923 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NACC1Q96RE7 527 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 PNMA2Q9UL42 364 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-215ENST00000549143 NRDCO43847 1150 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms