RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 RMDN3Q96TC7 470 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 MAF1Q9H063 256 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 TLE6Q9H808 572 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 SETD4Q9NVD3 440 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 GGPS1O95749 300 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 NR3C2P08235 984 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 FGRP09769 529 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 GHRP10912 638 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 MTMR3Q13615 1198 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 LPIN1Q14693 890 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.297e-8■■■□□ 18
CS-208ENST00000547298 NEK1Q96PY6 1258 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 NAPBQ9H115 298 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 CPVLQ9H3G5 476 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 EPG5Q9HCE0 2579 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 LGALS2P05162 132 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 NPR3P17342 541 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ERVFC1P60507 584 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ANKRD54Q6NXT1 300 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 APOL5Q9BWW9 433 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 PXMP2Q9NR77 195 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 FSCN2O14926 492 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ORC4O43929 436 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 GATMP50440 423 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ANGPT1Q15389 498 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 PANK1Q8TE04 598 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-208ENST00000547298 OPLAHO14841 1288 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 PPFIA3O75145 1194 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ASGR2P07307 311 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TECP42680 631 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 LMBR1Q8WVP7 490 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 POMKQ9H5K3 350 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MYO10Q9HD67 2058 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ZNF292O60281 2723 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ABCB11O95342 1321 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 AOC1P19801 751 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TRIM50Q86XT4 487 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 IL31RAQ8NI17 732 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HSD17B4P51659 736 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 GHRHRQ02643 423 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 UBE3AQ05086 875 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 DTWD2Q8NBA8 298 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 NR2E1Q9Y466 385 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HMMRO75330 724 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TGFB3P10600 412 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 GNAT1P11488 350 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CD52P31358 61 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ARHGAP4P98171 946 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 DCLK2Q8N568 766 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 FLCNQ8NFG4 579 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 GPR20Q99678 358 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 USP26Q9BXU7 913 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms