RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	KRT14	P02533	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KCNA4	P22459	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GNA11	P29992	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CXCR5	P32302	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NPEPPS	P55786	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ASIC1	P78348	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CALCRL	Q16602	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		Q4G0T1	1027 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MGAM	O43451	1857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TACC1	O75410	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MED24	O75448	989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PON1	P27169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FLT3	P36888	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	BTD	P43251	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RASSF7	Q02833	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GIT2	Q14161	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PTGIS	Q16647	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EPN3	Q9H201	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ALAS1	P13196	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LSP1	P33241	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GSTO1	P78417	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	AMPD3	Q01432	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PTK2	Q05397	1052 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	1e-12	■■■■■ 52
CTSC-208	ENST00000533897	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GJA10	Q969M2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MYO1F	O00160	1098 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZPR1	O75312	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ADRA2B	P18089	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CIITA	P33076	1130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RFC4	P35249	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NAPA	P54920	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KCNQ4	P56696	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ICE2	Q659A1	982 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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