RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 SESTD1Q86VW0 696 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM50Q86XT4 487 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SLC5A5Q92911 643 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 EMSYQ7Z589 1322 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 H3BRB1 525 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 WNT7AO00755 349 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 B4GALT4O60513 344 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 LGR5O75473 907 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ATG7O95352 703 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PCYT2Q99447 389 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 RIT2Q99578 217 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TBX21Q9UL17 535 aa16.81■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA0355O15063 1070 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 CHMP4BP1P59074 171 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GJA10Q969M2 543 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.8■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PSMD10O75832 226 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 HOXC8P31273 242 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 KRT76Q01546 638 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 HIC1Q14526 733 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 POTEDQ86YR6 584 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 WDR81Q562E7 1941 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TBX3O15119 743 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GAS7O60861 476 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ITGB8P26012 769 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 HSCBQ8IWL3 235 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 C7orf31Q8N865 590 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 HAS1Q92839 578 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 GLG1Q92896 1179 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 FAM20AQ96MK3 541 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-216ENST00000533817 WDR64B1ANS9 1081 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 H3BQV1 296 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 CYP2C9P11712 490 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 MARK3P27448 753 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 STAT5BP51692 787 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 PTGISQ16647 500 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 GDF15Q99988 308 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 AZI2Q9H6S1 392 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 VAV3Q9UKW4 847 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 CHMP2AO43633 222 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 NEMFO60524 1076 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 TIMP1P01033 207 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 PSAPP07602 524 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 RAG1P15918 1043 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 ATP2B1P20020 1258 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 TRAPPC10P48553 1259 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 JAK3P52333 1124 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-216ENST00000533817 ADAM17P78536 824 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms