RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	F13A1	P00488	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ALB	P02768	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	APP	P05067	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CELA3A	P09093	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NID1	P14543	1247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IRAK1	P51617	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	KIF2C	Q99661	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PLD2	O14939	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MAFG	O15525	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IL1R1	P14778	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GYG1	P46976	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TERF1	P54274	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CAP1	Q01518	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IL16	Q14005	1332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LAMB1	P07942	1786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GRM8	O00222	908 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MYO1B	O43795	1136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SIN3B	O75182	1162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NAT2	P11245	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ITPKA	P23677	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MMP14	P50281	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NEK2	P51955	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	HYAL2	Q12891	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CRHR2	Q13324	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GRIK5	Q16478	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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