RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 PBKQ96KB5 322 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 RMND1Q9NWS8 449 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 GALNT8Q9NY28 637 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CLSTN1O94985 981 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DEXIO95424 95 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SETSIPP0DME0 302 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MYBP10242 640 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CUL1Q13616 776 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 LRRC42Q9Y546 428 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TTC38Q5R3I4 469 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 KSR1Q8IVT5 923 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FERMT2Q96AC1 680 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 SERPINB4P48594 390 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 CCNG1P51959 295 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MTMR3Q13615 1198 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 SOGA3Q5TF21 947 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TAF4BQ92750 862 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TMEM87BQ96K49 555 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 NDNQ99608 321 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GBP1P32455 592 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PEX5P50542 639 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GALNTL6Q49A17 601 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RNF14Q9UBS8 474 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MUM1Q2TAK8 710 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TTC8Q8TAM2 541 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 IFT74Q96LB3 600 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 CDK17Q00537 523 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 DBN1Q16643 649 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PEX11AO75192 247 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 CALB2P22676 271 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 COPB2P35606 906 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ZNF131P52739 623 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 KRT23Q9C075 422 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ETS2P15036 469 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MMP13P45452 471 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 CENPTQ96BT3 561 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TPBGLP0DKB5 382 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 KRT2P35908 639 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 RCN2Q14257 317 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 NWD1Q149M9 1564 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 KRIT1O00522 736 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ENTPD5O75356 428 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ASRGL1Q7L266 308 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PXDNQ92626 1479 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 FCER1AP12319 257 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GSTT1P30711 240 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 GDAP1Q8TB36 358 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 PJA2O43164 708 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACS1-205ENST00000527224 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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