RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.93■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 VCANP13611 3396 aa27.93■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 TRANK1O15050 2925 aa27.92■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 ADCY7P51828 1080 aa27.92■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.92■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 NRCAMQ92823 1304 aa27.92■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 RFXAPO00287 272 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 MAFGO15525 162 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 ATP9AO75110 1047 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 GJB5O95377 273 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 AMHP03971 560 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 RCAN1P53805 252 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 TCTN1Q2MV58 587 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 IL27Q8NEV9 243 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 SEPT8Q92599 483 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 GLG1Q92896 1179 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 JADE2Q9NQC1 790 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.91■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF15O94989 841 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 FAM117BQ6P1L5 589 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 DBF4BQ8NFT6 615 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 RAD9AQ99638 391 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 LCHNA4D1U4 455 aa27.89■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 PPFIA1Q13136 1202 aa27.89■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 SIP14410 1827 aa27.89■■■□□ 2.06
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 EPOPA6NHQ4 379 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 STXBP3O00186 592 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MARK3P27448 753 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 FUT2Q10981 343 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MYOCDQ8IZQ8 938 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SDF4Q9BRK5 362 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 ANO3Q9BYT9 981 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 BARHL2Q9NY43 387 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.88■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 AP3B2Q13367 1082 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 PGBD1Q96JS3 809 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 ASB2Q96Q27 587 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.87■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SMCO2A6NFE2 343 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 REC8O95072 547 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 RSPH3Q86UC2 560 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 AZI2Q9H6S1 392 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.86■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 CDC27P30260 824 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 ADAM17P78536 824 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 GRIK4Q16099 956 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 Q6ZUG5 572 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 APBB2Q92870 758 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 INSL6Q9Y581 213 aa27.85■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 CPA1P15085 419 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 HSPA4P34932 840 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF76P36508 570 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 APOBRQ0VD83 1088 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 GRB10Q13322 594 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 CEP55Q53EZ4 464 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 BRF1Q92994 677 aa27.84■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 LINC01553A4QN01 128 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 AAK1Q2M2I8 961 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SPRED2Q7Z698 418 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 KCNB2Q92953 911 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 NFASCO94856 1347 aa27.83■■■□□ 2.05
SIMC1-211ENST00000514128 SCG2P13521 617 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 SREBF1P36956 1147 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 FAM26DQ5JW98 314 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 KRT40Q6A162 431 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM260Q9NX78 707 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 TRPC6Q9Y210 931 aa27.82■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SIMC1-211ENST00000514128 PSMA5P28066 241 aa27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms