RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511209.5

GPBP1-205, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene GPBP1, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-205	ENST00000511209	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPBP1-205	ENST00000511209	TMEM260	Q9NX78	707 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPBP1-205	ENST00000511209	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPBP1-205	ENST00000511209	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPBP1-205	ENST00000511209	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RAD50	Q92878	1312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ANAPC15	P60006	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	TCIRG1	Q13488	830 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	NCAPH	Q15003	741 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	DDB1	Q16531	1140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	JMY	Q8N9B5	988 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	PALD1	Q9ULE6	856 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	JCAD	Q9P266	1359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FAM170B	A6NMN3	283 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ADCY3	O60266	1144 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	STARD3NL	O95772	234 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	F13B	P05160	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	MCC	P23508	829 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	HSPA4	P34932	840 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ETV3	P41162	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	TFCP2	Q12800	502 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RNF141	Q8WVD5	230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	LRRN2	O75325	713 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	EPHX1	P07099	455 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	BBS9	Q3SYG4	887 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	APPBP2	Q92624	585 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	SHOX	O15266	292 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	PTMS	P20962	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	NFIA	Q12857	509 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	HLF	Q16534	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	FGD4	Q96M96	766 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	HAUS7	Q99871	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	GPR108	Q9NPR9	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209		U3KQE9	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	EYA2	O00167	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	HIP1	O00291	1037 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CIAO1	O76071	339 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	CSF1R	P07333	972 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ATP5J	P18859	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209		Q96M66	194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPBP1-205	ENST00000511209	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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