RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 GHRP10912 638 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-215ENST00000510074 SP4Q02446 784 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-215ENST00000510074 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-215ENST00000510074 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-215ENST00000510074 PLVAPQ9BX97 442 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-215ENST00000510074 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-215ENST00000510074 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM50Q86XT4 487 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP2-215ENST00000510074 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.33■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 TBX10O75333 385 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 SNX27Q96L92 541 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIP1O00291 1037 aa18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 LPIN1Q14693 890 aa18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 PPFIA1Q13136 1202 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 SEC23AQ15436 765 aa18.3■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 P2RX5Q93086 422 aa18.3■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 COL4A6Q14031 1691 aa18.3■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 ERICH2A1L162 156 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 ST18O60284 1047 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 EYA4O95677 639 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 GLG1Q92896 1179 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 NRIP1P48552 1158 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 EFHBQ8N7U6 833 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 SEPT1Q8WYJ6 367 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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