RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 TTC23LQ6PF05 361 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BBOF1Q8ND07 529 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NELL1Q92832 810 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SPACA7Q96KW9 195 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HAUS8Q9BT25 410 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HIP1O00291 1037 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZW10O43264 779 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 COL6A1P12109 1028 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IDEP14735 1019 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP6P59044 892 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MYLK3Q32MK0 819 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SLC51BQ86UW2 128 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FBF1Q8TES7 1133 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EGLN2Q96KS0 407 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FBP2O00757 339 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DDHD2O94830 711 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATG7O95352 703 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PRKACAP17612 351 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CYTH1Q15438 398 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HERVK_113Q902F9 699 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf4Q9NR00 106 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HACD3Q9P035 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CDC23Q9UJX2 597 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 YKT6O15498 198 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPIP5K2O43314 1243 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL41O60662 606 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CDK4P11802 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MYL6BP14649 208 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TMOD1P28289 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EVI2BP34910 448 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NR2C2P49116 596 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R2AP63151 447 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PIP4K2BP78356 416 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IGSF11Q5DX21 431 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HACE1Q8IYU2 909 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CHPFQ8IZ52 775 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATL1Q8WXF7 558 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KIFC2Q96AC6 838 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CIB1Q99828 191 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PLVAPQ9BX97 442 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KRT23Q9C075 422 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SYNMO15061 1565 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FIBPO43427 364 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R1AP30153 589 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EPS15P42566 896 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RELAQ04206 551 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CDONQ4KMG0 1287 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GALNT7Q86SF2 657 aa6.69□□□□□ -1.34
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