RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CLEC1BQ9P126 229 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 APPP05067 770 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2MP0CAP2 368 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 KCNA5P22460 613 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEA9P43362 315 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 ITIH3Q06033 890 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 HIC1Q14526 733 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 PNMA1Q8ND90 353 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 COPS5Q92905 334 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 WNT8BQ93098 351 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 YME1L1Q96TA2 773 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 KAT14Q9H8E8 782 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PATJQ8NI35 1801 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 SPATA33Q96N06 139 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CRBNQ96SW2 442 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 IRAK3Q9Y616 596 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 NID2Q14112 1375 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 TBX10O75333 385 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PRDM1O75626 825 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 DDAH1O94760 285 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SDHBP21912 280 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PPM1AP35813 382 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 LPIN1Q14693 890 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 LAG3P18627 525 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MTHFRP42898 656 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CDC42EP1Q00587 391 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CAMK1Q14012 370 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MIER1Q8N108 512 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CASP10Q92851 521 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 GGPS1O95749 300 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CHRNA1P02708 482 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 GNAQP50148 359 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PDE1AP54750 535 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 DSC3Q14574 896 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 IER2Q9BTL4 223 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 INPPL1O15357 1258 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CHGBP05060 677 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 THPOP40225 353 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA3FQ13275 785 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 IER5Q5VY09 327 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 CTNNB1P35222 781 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 RTL10Q7L3V2 364 aa8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.92□□□□□ -0.98
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PDE4D-210ENST00000503258 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF213O14771 459 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 TMTC2Q8N394 836 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.92□□□□□ -0.98
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