RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 CSF2RBP32927 897 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 FOXE3Q13461 319 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 FXNQ16595 210 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 STPG3Q8N7X2 389 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.18□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 LTFP02788 710 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PPP2R2AP63151 447 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PFKPQ01813 784 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 MAP4K2Q12851 820 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 TUSC3Q13454 348 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ADOQ96SZ5 270 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 KCND1Q9NSA2 647 aa7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 COL6A2P12110 1019 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 IER2Q9BTL4 223 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 KATNBL1Q9H079 304 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 AGRPO00253 132 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ETFBP38117 255 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 TGFB2P61812 414 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 FHL2Q14192 279 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 NRN1LQ496H8 165 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 USP53Q70EK8 1073 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 VPS37DQ86XT2 251 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 EPN3Q9H201 632 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 H0Y858 1186 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 DLX3O60479 287 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 MIIPQ5JXC2 388 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 CD276Q5ZPR3 534 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 CAPN10Q9HC96 672 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 A0A1W2PQU0 124 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 GJB6O95452 261 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 IL18BPO95998 194 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 AGBL4Q5VU57 503 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 EDAQ92838 391 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ZNF503Q96F45 646 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 KCNJ15Q99712 375 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ZNF839A8K0R7 811 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 GNAT1P11488 350 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 COMTP21964 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 FUKQ8N0W3 1084 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 EXTL1Q92935 676 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 DSEQ9UL01 958 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 GRK2P25098 689 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 GRK3P35626 688 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 RAC3P60763 192 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 LBX2Q6XYB7 198 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 CSRNP2Q9H175 543 aa7.11□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 PLSCR1O15162 318 aa7.1□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 KIZQ2M2Z5 673 aa7.1□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 DCAF4Q8WV16 495 aa7.1□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ACOT7O00154 380 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 POLD1P28340 1107 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 EPHA5P54756 1037 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ABHD18Q0P651 414 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 Q6ZSN1 163 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.09□□□□□ -1.27
CLTC-208ENST00000496076 ESYT3A0FGR9 886 aa7.08□□□□□ -1.28
CLTC-208ENST00000496076 RAD17O75943 681 aa7.08□□□□□ -1.28
CLTC-208ENST00000496076 ZNF202O95125 648 aa7.08□□□□□ -1.28
CLTC-208ENST00000496076 CR2P20023 1033 aa7.08□□□□□ -1.28
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