RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM129CQ86XR2 697 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC103Q8IW40 242 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 DIO2Q92813 273 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 PIK3R4Q99570 1358 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 BTG4Q9NY30 223 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP152O94986 1710 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NAIPQ13075 1403 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 C22orf46C9J442 243 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBTB7AO95365 584 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ASGR2P07307 311 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNAB2Q13303 367 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC9A5Q14940 896 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TESK1Q15569 626 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 UBXN4Q92575 508 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ALG3Q92685 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SGSM3Q96HU1 749 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PWWP2AQ96N64 755 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MPHOSPH9Q99550 1183 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF38Q9H0F5 515 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RGS12O14924 1447 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MYO1BO43795 1136 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NCAM1P13591 858 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ATF2P15336 505 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LTBRP36941 435 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 BCL6P41182 706 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 GTF2A2P52657 109 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP68Q76N32 757 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf159Q96HA4 380 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 IER2Q9BTL4 223 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LRP6O75581 1613 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MST1RQ04912 1400 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LCP1P13796 627 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FPR2P25090 351 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PMLP29590 882 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MC3RP41968 323 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LIMS1P48059 325 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FOXO4P98177 505 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP4K2Q12851 820 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MROH9Q5TGP6 573 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM169Q96HH4 297 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 POGKQ9P215 609 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 X6R8D5 127 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 HFM1A2PYH4 1435 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC144AA2RUR9 1427 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PDPK1O15530 556 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SGSM2O43147 1006 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DLX3O60479 287 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 BMP7P18075 431 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LSAMPQ13449 338 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SERINC3Q13530 473 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 VMACQ2NL98 169 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NLRP10Q86W26 655 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 Q8N1Y9 231 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms