RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 MYO1CO00159 1063 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 EML1O00423 815 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 ZNF185O15231 689 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 KRT86O43790 486 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 TUBB2AQ13885 445 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 CCDC174Q6PII3 467 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 RGL1Q9NZL6 768 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-213ENST00000492657 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 RSPH10BP0C881 870 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SREBF1P36956 1147 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 DRC1Q96MC2 740 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.21□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CCDC151A5D8V7 595 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 POLD1P28340 1107 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 KIF11P52732 1056 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 VSNL1P62760 191 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CDK17Q00537 523 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 GIT2Q14161 759 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SPA17Q15506 151 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 Q4G0T1 1027 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 NOL4O94818 638 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CFBP00751 764 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ZNF76P36508 570 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MMP14P50281 582 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 VAV2P52735 878 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 FAM193AP78312 1265 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 KIF5AQ12840 1032 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 REEP2Q9BRK0 252 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 DEF6Q9H4E7 631 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ABCB6Q9NP58 842 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SFI1A8K8P3 1242 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 AKR1B10O60218 316 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ADAM9Q13443 819 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PDXDC1Q6P996 788 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SFR1Q86XK3 245 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 VAV3Q9UKW4 847 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 DNM3Q9UQ16 869 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 UTRNP46939 3433 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ABCB11O95342 1321 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB39O15060 712 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MOCS3O95396 460 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SPDYE6P0CI01 402 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 RPA1P27694 616 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 HOXD13P35453 343 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 BRD3Q15059 726 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SLC15A2Q16348 729 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 VEZTQ9HBM0 779 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 TLR2O60603 784 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 MYBP10242 640 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 VPS18Q9P253 973 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 RAB21Q9UL25 225 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-213ENST00000492657 HINFPQ9BQA5 517 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms