RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	SREBF1	P36956	1147 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	UBA7	P41226	1012 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MRE11	P49959	708 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GRIN1	Q05586	938 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	KCTD2	Q14681	263 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TBX3	O15119	743 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TIMP1	P01033	207 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PGK2	P07205	417 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CIITA	P33076	1130 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TXK	P42681	527 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	HSD17B4	P51659	736 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GHRHR	Q02643	423 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PDIA5	Q14554	519 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	IL17A	Q16552	155 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	NCOR1	O75376	2440 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	EDIL3	O43854	480 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TDP2	O95551	362 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CAVIN2	O95810	425 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	COPB2	P35606	906 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	STAT3	P40763	770 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TEC	P42680	631 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ACLY	P53396	1101 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19	2e-6	■■■□□ 17.3
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954		Q4G0T1	1027 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	POTED	Q86YR6	584 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	GBF1	Q92538	1859 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	NFIB	O00712	420 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC37A4	O43826	429 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNA10	Q16322	511 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	PDILT	Q8N807	584 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	DHX58	Q96C10	678 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CIZ1-223	ENST00000491954	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.83	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms