RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489838.5

WDR48-210, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 3

Gene WDR48, Length 360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-210ENST00000489838 OSTM1Q86WC4 334 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 NOX5Q96PH1 765 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 CD244Q9BZW8 370 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.37□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 B4E1Z4 1266 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 RFPL3O75679 317 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 NPTXRO95502 500 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 LRG1P02750 347 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 CKMP06732 381 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 IGFALSP35858 605 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.36□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 OPA1O60313 960 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SASH1O94885 1247 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 ASLP04424 464 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 AMY2AP04746 511 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 AMY2BP19961 511 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 ITGA1P56199 1179 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 JAM2P57087 298 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 NFKB2Q00653 900 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 VMACQ2NL98 169 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SYT3Q9BQG1 590 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TBX22Q9Y458 520 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.35□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TLDC2A0PJX2 215 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 MAN2B1O00754 1011 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 FAHP16930 419 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 KCNA6P17658 529 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TKFCQ3LXA3 575 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 FIGNQ5HY92 759 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 STK32CQ86UX6 486 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 KYQ8NBH2 561 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.34□□□□□ -1.23
WDR48-210ENST00000489838 FFAR3O14843 346 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 IGSF3O75054 1194 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 VWA3BQ502W6 1294 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SP8Q8IXZ3 490 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TTLL6Q8N841 843 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 FEZ1Q99689 392 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ENPP3O14638 875 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 KCNK3O14649 394 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SDSP20132 328 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 GJA4P35212 333 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 FLT3P36888 993 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TMEM177Q53S58 311 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 VASNQ6EMK4 673 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SYT8Q8NBV8 401 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TMEM209Q96SK2 561 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 NTMQ9P121 344 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SH3D21A4FU49 640 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ACOT7O00154 380 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 THBS2P35442 1172 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ADAM9Q13443 819 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ZNF460Q14592 562 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 NINJ1Q92982 152 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 TEPSINQ96N21 525 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms