RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DYMQ7RTS9 669 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TMC6Q7Z403 805 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MB21D1Q8N884 522 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 OTUD5Q96G74 571 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 RMDN3Q96TC7 470 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ACAD9Q9H845 621 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 JADE2Q9NQC1 790 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PXMP2Q9NR77 195 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DNM3Q9UQ16 869 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRFP10586 1907 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 BICDL2A1A5D9 508 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EML1O00423 815 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP2AO43633 222 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D8O95759 1140 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IDEP14735 1019 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MUTP22033 750 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CCNE1P24864 410 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CLCN1P35523 988 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC12A3P55017 1021 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PLS1Q14651 629 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNL1Q8IU54 200 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 VSTM4Q8IW00 320 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CHST13Q8NET6 341 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 NEK9Q8TD19 979 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 P2RX5Q93086 422 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 OPTNQ96CV9 577 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.56□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GTH6 734 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IRF6O14896 467 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EYA4O95677 639 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FCER1AP12319 257 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP11B2P19099 503 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CCND2P30279 289 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP4A11Q02928 519 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EHHADHQ08426 723 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 STK4Q13043 487 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 COASYQ13057 564 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR1Q13613 665 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EPHA7Q15375 998 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TTI2Q6NXR4 508 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 LBX2Q6XYB7 198 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DYDC2Q96IM9 177 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM47Q96LD4 638 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPN18Q99952 460 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 THAP9Q9H5L6 903 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PANK4Q9NVE7 773 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 INTS13Q9NVM9 706 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 RGL1Q9NZL6 768 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO40Q9UH90 709 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.55□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNJ18B7U540 433 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 COBLO75128 1261 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMC6P62333 389 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNJ12Q14500 433 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms