RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 EPOPA6NHQ4 379 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CA3P07451 260 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ITGB5P18084 799 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ICAM3P32942 547 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 NLRP5P59047 1200 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ARHGAP1Q07960 439 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TTLL4Q14679 1199 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 LY6KQ17RY6 165 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GNASQ5JWF2 1037 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TMX3Q96JJ7 454 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ALG1Q9BT22 464 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 EDIL3O43854 480 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MCM2P49736 904 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 BEX3Q00994 111 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SP2Q02086 613 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MCTP2Q6DN12 878 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 BLIDQ8IZY5 108 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 BICD2Q8TD16 824 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 WASF1Q92558 559 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FBXL18Q96ME1 805 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FIBPO43427 364 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CYP3A4P08684 503 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ARHGAP4P98171 946 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GNPTABQ3T906 1256 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GALNT17Q6IS24 598 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GJD3Q8N144 294 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 KCNH6Q9H252 994 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 A6NJR5 290 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GH1P01241 217 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TGFB3P10600 412 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ALADP13716 330 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 OXER1Q8TDS5 423 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GPRASP2Q96D09 838 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FAM86B1E9PN63 330 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 ATP9AO75110 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 GGPS1O95749 300 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 KCNA2P16389 499 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 XBP1P17861 261 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 NLRX1Q86UT6 975 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 TNFRSF25Q93038 417 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 SCLYQ96I15 445 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 JADE2Q9NQC1 790 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MEIS1O00470 390 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MMP1P03956 469 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MMP3P08254 477 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CIITAP33076 1130 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CPT1AP50416 773 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 FOSBP53539 338 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 TAP1Q03518 808 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 GRB10Q13322 594 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 MTMR1Q13613 665 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CUL4AQ13619 759 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 ITGA7Q13683 1181 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CEP55Q53EZ4 464 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 AFG1LQ8WV93 481 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 LENG9Q96B70 501 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 VWCEQ96DN2 955 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-211ENST00000486204 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms