RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAT1P11488 350 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC5A1P13866 664 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GLB1P16278 677 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AGXTP21549 392 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CD40P25942 277 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 RXRBP28702 533 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL6P41182 706 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LAPTM5Q13571 262 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SP110Q9HB58 689 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR33A8MZF0 331 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP5K1CO60331 668 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HRGP04196 525 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AMY2AP04746 511 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 POU2F2P09086 479 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SRFP11831 508 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AMY2BP19961 511 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 C5AR1P21730 350 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR78Q5VTH9 848 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD4AQ8N468 514 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K14Q99558 947 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 JAM3Q9BX67 310 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H423 210 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 H7BY64 318 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM87AP0C7U9 286 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ECE1P42892 770 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LLGL1Q15334 1064 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZS46 218 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP10Q86W26 655 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SCLT1Q96NL6 688 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PLVAPQ9BX97 442 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSS2Q9NR19 701 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TCFL5Q9UL49 500 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf72A4D263 438 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM227AF5H4B4 570 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP17A1P05093 508 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SLURP2P0DP57 97 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 OSMP13725 252 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TYRP1P17643 537 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPP1P22413 925 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TM4SF4P48230 202 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MTNR1BP49286 362 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM193AP78312 1265 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ALFQ53S48 1182 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TOR2AQ5JU69 321 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SKAP1Q86WV1 359 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT16Q8N8M0 369 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 POF1BQ8WVV4 589 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 BTG4Q9NY30 223 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MSRAQ9UJ68 235 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms