RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 APOBRQ0VD83 1088 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 FUT2Q10981 343 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 Q6ZUG5 572 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 JADE2Q9NQC1 790 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 REV3LO60673 3130 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 SMCO2A6NFE2 343 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 STXBP3O00186 592 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 EFCAB14O75071 495 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ARHGEF15O94989 841 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 CDC27P30260 824 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 TAP1Q03518 808 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 GLG1Q92896 1179 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 BRF1Q92994 677 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 HSPA4P34932 840 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 BARHL2Q9NY43 387 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 LCHNA4D1U4 455 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ANO3Q9BYT9 981 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 TMEM260Q9NX78 707 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 NRCAMQ92823 1304 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 EPOPA6NHQ4 379 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 MAFGO15525 162 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 REC8O95072 547 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 RCAN1P53805 252 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 PPFIA1Q13136 1202 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 KCNB2Q92953 911 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 THEGQ9P2T0 379 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 CAND2O75155 1236 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 GJB5O95377 273 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 AMHP03971 560 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 ZNF76P36508 570 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SEPT8Q92599 483 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 RAD9AQ99638 391 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SDF4Q9BRK5 362 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 NEFLP07196 543 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SPRED2Q7Z698 418 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 ARP10275 920 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SCG2P13521 617 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 RPS6KB1P23443 525 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 IGBP1P78318 339 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 AP3B2Q13367 1082 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 GRIK4Q16099 956 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 CEP55Q53EZ4 464 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 AZI2Q9H6S1 392 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PSMA5P28066 241 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 ADAM17P78536 824 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 KRT40Q6A162 431 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PPFIA3O75145 1194 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 SREBF1P36956 1147 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 PHKBQ93100 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TRPC6Q9Y210 931 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 TTC28Q96AY4 2481 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms