RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 USP40Q9NVE5 1235 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FAHP16930 419 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DNM2P50570 870 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 JAM2P57087 298 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 RGL3Q3MIN7 710 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 C2orf27AQ580R0 203 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 LNPKQ9C0E8 428 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 WNT9AO14904 365 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CKMP06732 381 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF28P17035 718 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHA5P54756 1037 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXW5Q969U6 566 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DRC1Q96MC2 740 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC66A2RUB6 948 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 MAN2B1O00754 1011 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CNR2P34972 360 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 IL13P35225 146 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 GLRBP48167 497 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 GJA9P57773 515 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SQSTM1Q13501 440 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CD276Q5ZPR3 534 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 VASNQ6EMK4 673 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 BRAPQ7Z569 592 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 DTX3Q8N9I9 347 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CLIC6Q96NY7 704 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 PIF1Q9H611 641 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 RAPGEF3O95398 923 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 ST5P78524 1137 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 PFKPQ01813 784 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR19Q15760 415 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TEPSINQ96N21 525 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM209Q96SK2 561 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 COL6A1P12109 1028 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNA6P17658 529 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SEC23AQ15436 765 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 UBXN11Q5T124 520 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CPZQ66K79 652 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CXorf38Q8TB03 319 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 BDH2Q9BUT1 245 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 DLL4Q9NR61 685 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 MROH6A6NGR9 719 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 IL18BPO95998 194 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 SYN1P17600 705 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 NFE2L2Q16236 605 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 CRY1Q16526 586 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 TM4SF20Q53R12 229 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 STPG3Q8N7X2 389 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 UBXN4Q92575 508 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 NUDT11Q96G61 164 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-206ENST00000467748 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms