RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 GMCL1Q96IK5 515 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 AMNQ9BXJ7 453 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 PANK4Q9NVE7 773 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 WDR90Q96KV7 1748 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CES2O00748 559 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 GFPT2O94808 682 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CYP3A4P08684 503 aa9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 RPA1P27694 616 aa9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 SLC1A4P43007 532 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 TNNI2P48788 182 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 HERVK_113P62684 666 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.4□□□□□ -0.9
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ACTB-208ENST00000464611 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 TMEM260Q9NX78 707 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 DNM3Q9UQ16 869 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 MTMR7Q9Y216 660 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-208ENST00000464611 SCN4AP35499 1836 aa9.4□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 PIK3CDO00329 1044 aa9.39□□□□□ -0.91
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ACTB-208ENST00000464611 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 RAD17O75943 681 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 TDP2O95551 362 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G4BP0C869 781 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 MAGEA1P43355 309 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 CRKP46108 304 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 KIF11P52732 1056 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 CXCL9Q07325 125 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 COASYQ13057 564 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 PICALMQ13492 652 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 NFIL3Q16649 462 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.39□□□□□ -0.91
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ACTB-208ENST00000464611 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.39□□□□□ -0.91
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ACTB-208ENST00000464611 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.39□□□□□ -0.91
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ACTB-208ENST00000464611 HAS1Q92839 578 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 NOX5Q96PH1 765 aa9.39□□□□□ -0.91
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ACTB-208ENST00000464611 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 KCND2Q9NZV8 630 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 PNMA2Q9UL42 364 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 SNX12Q9UMY4 172 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ACTB-208ENST00000464611 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.38□□□□□ -0.91
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