RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FSD1Q9BTV5 496 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 MXD3Q9BW11 206 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 JAG2Q9Y219 1238 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ZZEF1O43149 2961 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 GPSM2P81274 684 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 SUSD4Q5VX71 490 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT40Q6A162 431 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 STK35Q8TDR2 534 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 COA7Q96BR5 231 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 USTQ9Y2C2 406 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM186AA6NE01 2351 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PSME4Q14997 1843 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FRYQ5TBA9 3013 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NTSR2O95665 410 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2C8P10632 490 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 IL9P15248 144 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FPGSQ05932 587 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 RAB30Q15771 203 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 TMC4Q7Z404 712 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 CLRN2A0PK11 232 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PICK1Q9NRD5 415 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 USP16Q9Y5T5 823 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 GAKO14976 1311 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 M0R296 226 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 UFL1O94874 794 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 AFMP43652 599 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM60Q495X7 471 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PPM1JQ5JR12 505 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PI16Q6UXB8 463 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NGEFQ8N5V2 710 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-203ENST00000459697 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP98P52948 1817 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 RAG1P15918 1043 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIL2Q13356 520 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 RASA3Q14644 834 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ERO1BQ86YB8 467 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.45e-18■□□□□ 11.2
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