RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IDO1P14902 403 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANXA13P27216 316 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC1A1P43005 524 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IFNAR2P48551 515 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC10P48553 1259 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY1A3Q02108 690 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KRT81Q14533 505 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF3Q86WH2 238 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPERTQ8NA61 448 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RUBCNQ92622 972 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AIDAQ96BJ3 306 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FANCFQ9NPI8 374 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DPPA5A6NC42 116 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A2P04920 1241 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLCO1A2P46721 670 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCR3P51677 355 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RAB15P59190 212 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RAB14P61106 215 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PDE4BQ07343 736 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GALNT7Q86SF2 657 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 C14orf80Q86SX3 495 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CABP7Q86V35 215 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 JDP2Q8WYK2 163 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KIFC2Q96AC6 838 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPC25Q9HBM1 224 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 USP27XA6NNY8 438 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RGL2O15211 777 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZWINTO95229 277 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DSTNP60981 165 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RUNX1T1Q06455 604 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AP1B1Q10567 949 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPARCL1Q14515 664 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 STK11Q15831 433 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PACS1Q6VY07 963 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KRT74Q7RTS7 529 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 LUZP2Q86TE4 346 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CEP19Q96LK0 163 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PSKH2Q96QS6 385 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEB16A2A368 324 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN4O14817 238 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PGM3O95394 542 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GSTA1P08263 222 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GRK2P25098 689 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K12Q12852 859 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GIN1Q9NXP7 522 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GMIPQ9P107 970 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 E2F3O00716 465 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RAD51BO15315 384 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CUTAO60888 179 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYND10O75800 440 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CLUP10909 449 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms