RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 CDC27P30260 824 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 APOBRQ0VD83 1088 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 HIC1Q14526 733 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 GPNMBQ14956 572 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 RSPH3Q86UC2 560 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 WNT8BQ93098 351 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ANO3Q9BYT9 981 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 AMHP03971 560 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 SCG2P13521 617 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 RPS6KB1P23443 525 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 CEP55Q53EZ4 464 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 FBXL16Q8N461 479 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 SEPT8Q92599 483 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 C6orf50Q9HD87 102 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 CPA1P15085 419 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 PPFIA1Q13136 1202 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ADGRE1Q14246 886 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 RAD9AQ99638 391 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 GJB5O95377 273 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CTSHP09668 335 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 GNA11P29992 359 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SREBF1P36956 1147 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TAP1Q03518 808 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MBTPS1Q14703 1052 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 APBB2Q92870 758 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 NFASCO94856 1347 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ESYT2A0FGR8 921 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MARK3P27448 753 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 DEFB103AP81534 67 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 USP38Q8NB14 1042 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 BICD2Q8TD16 824 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PGBD1Q96JS3 809 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CERS4Q9HA82 394 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SCN5AQ14524 2016 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0C4DFX4 3053 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ADAM17P78536 824 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 GRIK4Q16099 956 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 IL27Q8NEV9 243 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM260Q9NX78 707 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 THEGQ9P2T0 379 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TRPC6Q9Y210 931 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 INSL6Q9Y581 213 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MEIS1O00470 390 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ACTR2P61160 394 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 NID2Q14112 1375 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 RUFY3Q7L099 469 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 RPAINQ86UA6 219 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CDH23Q9H251 3354 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ARP10275 920 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SLC26A2P50443 739 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 STAT5BP51692 787 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 FAM26DQ5JW98 314 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 M0QZ92 97 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 IGBP1P78318 339 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms