RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 BARHL2Q9NY43 387 aa22.38■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 MAFGO15525 162 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 EFCAB14O75071 495 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 LGR5O75473 907 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 MARK3P27448 753 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 PSMA5P28066 241 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 DEFB103AP81534 67 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 MBTPS1Q14703 1052 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 KCNB2Q92953 911 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.37■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 HOXC8P31273 242 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF76P36508 570 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TCTN1Q2MV58 587 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 ANO3Q9BYT9 981 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM260Q9NX78 707 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TET1Q8NFU7 2136 aa22.36■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 RFXAPO00287 272 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 RPS6KB1P23443 525 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 SDF4Q9BRK5 362 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 NRCAMQ92823 1304 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 VCANP13611 3396 aa22.35■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 SCG2P13521 617 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TAP1Q03518 808 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 PPFIA1Q13136 1202 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 AP3B2Q13367 1082 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 AZI2Q9H6S1 392 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.34■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 CAND2O75155 1236 aa22.33■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 CEP55Q53EZ4 464 aa22.33■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.33■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.33■■□□□ 1.17
NPAS1-201ENST00000439365 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.33■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 PPFIA3O75145 1194 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF15O94989 841 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 AMHP03971 560 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ARP10275 920 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 IGBP1P78318 339 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SEPT8Q92599 483 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 RAD9AQ99638 391 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 C6orf50Q9HD87 102 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 MYO9BQ13459 2157 aa22.32■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 LCHNA4D1U4 455 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 GJB5O95377 273 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 GRIK4Q16099 956 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 RSPH3Q86UC2 560 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 PHKBQ93100 1093 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TRPC6Q9Y210 931 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 EPOPA6NHQ4 379 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SREBF1P36956 1147 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ADAM17P78536 824 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 THEGQ9P2T0 379 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.31■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 NFASCO94856 1347 aa22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ACTR2P61160 394 aa22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.3■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 GNA11P29992 359 aa22.29■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.29■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 RUFY3Q7L099 469 aa22.29■■□□□ 1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SPRED2Q7Z698 418 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms