RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 POTEFA5A3E0 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MED24O75448 989 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PSAPP07602 524 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CCDC192P0DO97 292 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 KCNA4P22459 653 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PNOCQ13519 176 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 E2F4Q16254 413 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 POTEGQ6S5H5 508 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SCFD2Q8WU76 684 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 STAMQ92783 540 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SMARCE1Q969G3 411 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PNMA5Q96PV4 448 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 RGL1Q9NZL6 768 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DNM3Q9UQ16 869 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 BACH1O14867 736 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 FOXN1O15353 648 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 GGPS1O95749 300 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PRR29P0C7W0 189 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 HSPA6P17066 643 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 HOXD10P28358 340 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ZNF445P59923 1031 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 LY6KQ17RY6 165 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 HYIQ5T013 277 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 BANK1Q8NDB2 785 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 RDM1Q8NG50 284 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 RAD54LQ92698 747 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 TSPY26PQ9H489 355 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 E9PMD0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MUTP22033 750 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ACTR2P61160 394 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SP2Q02086 613 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ACVR2BQ13705 512 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MCM6Q14566 821 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ARHGEF6Q15052 776 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ECM1Q16610 540 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 TRIM47Q96LD4 638 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 LXNQ9BS40 222 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 BIN1O00499 593 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CCNE2O96020 404 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 HOXC6P09630 235 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PLA2G4BP0C869 781 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 C1QTNF8P60827 252 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 PSMC5P62195 406 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 METTL7BQ6UX53 244 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ERO1AQ96HE7 468 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SPATA33Q96N06 139 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 NACC1Q96RE7 527 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 GJD2Q9UKL4 321 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-206ENST00000431381 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms