RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 KCNK3O14649 394 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KIZQ2M2Z5 673 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PRR31Q5SQ13 230 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL6Q8N841 843 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CXorf38Q8TB03 319 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RAPGEF3O95398 923 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CELA3BP08861 270 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 GLRBP48167 497 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP10-2P60368 255 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 PLP2Q04941 152 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TKFCQ3LXA3 575 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 ALG1Q9BT22 464 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CADPSQ9ULU8 1353 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ANKRD62A6NC57 917 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ACOT7O00154 380 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 AQP7O14520 342 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PLD2O14939 933 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MAFKO60675 156 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CKMP06732 381 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PYGMP11217 842 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KRT15P19012 456 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 GYS2P54840 703 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RBM10P98175 930 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 BRAPQ7Z569 592 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NIM1KQ8IY84 436 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PTPRN2Q92932 1015 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRC-208ENST00000427110 OSTM1Q86WC4 334 aa3.48□□□□□ -1.85
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