RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CLEC1BQ9P126 229 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 FAM186AA6NE01 2351 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CACNA1HO95180 2353 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 KPNA6O60684 536 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 LILRB3O75022 631 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 VSIG8P0DPA2 414 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 OAZ1P54368 228 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 PDE4BQ07343 736 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 PPP2R5BQ15173 497 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC184Q52MB2 194 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 FLCNQ8NFG4 579 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 ALG1Q9BT22 464 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 PRKAB2O43741 272 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 BMPR1AP36894 532 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 NRIP1P48552 1158 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 PDE4DQ08499 809 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 COASYQ13057 564 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 ANGPT1Q15389 498 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 LCORLQ8N3X6 602 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 DCLK2Q8N568 766 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 TOP1MTQ969P6 601 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 DLL3Q9NYJ7 618 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 FEM1BQ9UK73 627 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-202ENST00000423431 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.46□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MAN1A2O60476 641 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 RB1P06400 928 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 SNAP25P60880 206 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MTMR3Q13615 1198 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MBTPS1Q14703 1052 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 EFHBQ8N7U6 833 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 C7orf31Q8N865 590 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 IL17RAQ96F46 866 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 APOL5Q9BWW9 433 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ARMT1Q9H993 441 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 R4GN57 208 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TRIOO75962 3097 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 A6NJR5 290 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM232C9JQI7 657 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 BRD1O95696 1058 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MMP1P03956 469 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 BMP2P12643 396 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 CHST3Q7LGC8 479 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 MEIOBQ8N635 442 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 WNT8BQ93098 351 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 HAUS7Q99871 368 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 EMSYQ7Z589 1322 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 C5orf67F2Z3F1 127 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 RSPH10BP0C881 870 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 FSHRP23945 695 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 THPOP40225 353 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 RBL2Q08999 1139 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 PTK7Q13308 1070 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 TKFCQ3LXA3 575 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 C12orf60Q5U649 245 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SPCS1-202ENST00000423431 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms