RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CHP1Q99653 195 aa22.33■■□□□ 1.17
SUMO3-204ENST00000411651 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.33■■□□□ 1.17
SUMO3-204ENST00000411651 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.33■■□□□ 1.17
SUMO3-204ENST00000411651 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SUMO3-204ENST00000411651 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.33■■□□□ 1.17
SUMO3-204ENST00000411651 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TRAF5O00463 557 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP25P42331 645 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 USP14P54578 494 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.169e-9■■□□□ 13.4
SUMO3-204ENST00000411651 MNS1Q8NEH6 495 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D5Q92609 795 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 REEP2Q9BRK0 252 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.33■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TADA3O75528 432 aa22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PSMC6P62333 389 aa22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TUBB4BP68371 445 aa22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EML1O00423 815 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PDXKO00764 312 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 INPP5BP32019 993 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EPHA7Q15375 998 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 DCAF15Q66K64 600 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 GAS7O60861 476 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CETN3O15182 167 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SLITRK3O94933 977 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ELF2Q15723 593 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 MICALL2Q8IY33 904 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 UBE4BO95155 1302 aa22.3■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SHTN1A0MZ66 631 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CTAGE9A4FU28 777 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 DOCK1Q14185 1865 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NFIL3Q16649 462 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 UBXN4Q92575 508 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NACC1Q96RE7 527 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 KLK7P49862 253 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SFR1Q86XK3 245 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.29■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CYP4A11Q02928 519 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 UIMC1Q96RL1 719 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 MAF1Q9H063 256 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CDC23Q9UJX2 597 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 LCA5LO95447 670 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 ADAM9Q13443 819 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NEK11Q8NG66 645 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CARD6Q9BX69 1037 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 RGL1Q9NZL6 768 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CEP72Q9P209 647 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 HACL1Q9UJ83 578 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-204ENST00000411651 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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